More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2346 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2346  LacI family transcription regulator  100 
 
 
341 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  66.27 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  63.91 
 
 
348 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21780  Transcriptional regulator, LacI family  64.49 
 
 
323 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  39.6 
 
 
334 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 
356 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 
343 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  40.2 
 
 
347 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 
340 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  36.36 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  36.36 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  38.41 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  36.36 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 
340 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 
348 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  37.29 
 
 
331 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0968  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 
347 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384319  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  34.04 
 
 
337 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  34.57 
 
 
342 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4193  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 
338 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 
338 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  32.53 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 
375 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  36.16 
 
 
355 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
346 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  34.92 
 
 
349 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  31.6 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  34.59 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 
364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.62 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02173  transcription regulator transcription regulator protein  35.41 
 
 
350 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291337  normal  0.0882857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
332 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3909  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 
344 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.046633  normal  0.0899887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  32.29 
 
 
341 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4299  regulatory protein, LacI  36.26 
 
 
348 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 
349 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.58 
 
 
331 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.7 
 
 
332 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 
332 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 
332 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 
331 aa  169  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  30.06 
 
 
336 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 
357 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  30.59 
 
 
331 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  30.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  30.59 
 
 
353 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  30.59 
 
 
353 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  30.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  30.59 
 
 
353 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  30.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  30.59 
 
 
353 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  33.77 
 
 
349 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.7 
 
 
332 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  32.3 
 
 
332 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  32.5 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.91 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.478263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  29.93 
 
 
331 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  32.45 
 
 
338 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  29.93 
 
 
331 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  29.93 
 
 
331 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.9 
 
 
355 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  31.92 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33920  LacI family transcriptional regulator protein  34.81 
 
 
388 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  29.93 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 
340 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 
356 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  31.56 
 
 
338 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  29.72 
 
 
333 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  31.34 
 
 
354 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 
331 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  31.34 
 
 
343 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 
343 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5309  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 
332 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2432  alanine racemase  35.02 
 
 
365 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5013  transcriptional regulator, LacI family  35.2 
 
 
332 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771857  normal  0.165296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  30 
 
 
335 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 
364 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 
312 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>