More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl138 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  360  4e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  71.11 
 
 		 180 aa  265  2e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf426  50S ribosomal protein L6  57.22 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  58.52 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  57.95 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  200  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  56.98 
 
 		 183 aa  197  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  56.98 
 
 		 183 aa  197  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  53.26 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  55.23 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  53.41 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  48.86 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>