133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4059 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  245  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  96.95 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  93.13 
 
 		 131 aa  205  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  89.23 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  78.46 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  73.44 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  62.1 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  52.27 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  53.97 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  60.32 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  51.56 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  49.23 
 
 		 144 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  48.85 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  51.38 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  51.56 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  50.78 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  50.78 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  50.78 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  50.78 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  50.78 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  50 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  52.1 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  49.58 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  50 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  41.35 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  42.59 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.1 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  40.83 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.64 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  39.17 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  43.81 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.31 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  37.41 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  37.5 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.44 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  38.1 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.78 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.51 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  37.69 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.47 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  33.59 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  39.08 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  39.08 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  40.44 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  40 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  35.29 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  44.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  35.58 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.74 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  36.29 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.54 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  38.66 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  41.6 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  40.31 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  39.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.97 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  38.98 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  37.36 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  36.46 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  45.57 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  37.3 
 
 		 281 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.76 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  37.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  32.28 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  41.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0916  hypothetical protein  45.56 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000281771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  36.14 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.2 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  35.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  38.38 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  40.62 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  42.42 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.81 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  38.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  38.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  38.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>