59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0894 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  99.52 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  95.15 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  75.71 
 
 		 192 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  71.35 
 
 		 198 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  74.39 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  42.22 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  36.32 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  39.47 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  42.61 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  35 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  34.18 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  31.79 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  31.79 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  34.55 
 
 		 378 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  34.08 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  36.72 
 
 		 398 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.37 
 
 		 367 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  33.57 
 
 		 390 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  30.68 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  29.08 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  29.38 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  32.67 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  29.17 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  31.11 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  28.48 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  28.32 
 
 		 247 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.92 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.57 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  27.4 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  29.23 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  26.03 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  30.37 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  25.68 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  25.68 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.7 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  26.28 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  23.13 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.97 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 		 101 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.94 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  20.63 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  28.86 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  27.86 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  21.05 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.4 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  21.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  24.35 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  21.05 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2842  hypothetical protein  26.39 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.92 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>