More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0451 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0451  rare lipoprotein A  100 
 
 		 64 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  0.956063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  90.62 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  92.19 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  81.25 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  81.25 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  78.12 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  80.33 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  80.33 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  80.33 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  75 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  75 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  74.6 
 
 		 358 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  73.77 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  73.02 
 
 		 324 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  75.41 
 
 		 371 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 367 aa  87.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  68.25 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  63.49 
 
 		 360 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  63.49 
 
 		 360 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  68.25 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  65.08 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  65.57 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  65.57 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  65.62 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  70.49 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  70.49 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  61.9 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  75.47 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  64.62 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  69.84 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  65.08 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  63.93 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  61.9 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  60.61 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  65.57 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  68.85 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  70.59 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  70.49 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  70.49 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 335 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  68.85 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  71.15 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  58.73 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  65.08 
 
 		 249 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  65.45 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  65.45 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  65.45 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  68.85 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  67.86 
 
 		 257 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  60.94 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  61.9 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  63.49 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  65.57 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  61.9 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  63.93 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  69.09 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  67.21 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  67.21 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3250  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.314972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 211 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  67.31 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  67.21 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  65.57 
 
 		 367 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  62.3 
 
 		 342 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  61.9 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  60.32 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  61.9 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  60.94 
 
 		 255 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  69.09 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  65.45 
 
 		 254 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  65.45 
 
 		 238 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  62.26 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  62.3 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  62.26 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  64.71 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  60.66 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  63.49 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>