More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4317 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  67.75 
 
 		 596 aa  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  71.6 
 
 		 559 aa  803    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  64.66 
 
 		 612 aa  755    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  67.35 
 
 		 560 aa  713    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  74.48 
 
 		 557 aa  807    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  64.23 
 
 		 597 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  100 
 
 		 579 aa  1177    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  64.05 
 
 		 571 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3729  plasmid partitioning protein  45.41 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183946  normal  0.190659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  32.1 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  35.16 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  29.73 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 297 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  39.62 
 
 		 286 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.59 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.59 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.59 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  34.38 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.59 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  39.58 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  39.58 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38.32 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  29.68 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  36.73 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.59 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.56 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  26.25 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.86 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  33.05 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  32.81 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  32.74 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 		 288 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.78 
 
 		 303 aa  57  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  36.3 
 
 		 281 aa  57  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  32.54 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  36.63 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  38.61 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  37.01 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  33.85 
 
 		 303 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.54 
 
 		 321 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.71 
 
 		 294 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.71 
 
 		 294 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  33.08 
 
 		 303 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  33.85 
 
 		 303 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  37.93 
 
 		 289 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  34.23 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  28.38 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  25.88 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  33.62 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  32.54 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.47 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.67 
 
 		 304 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  30.97 
 
 		 297 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  34.81 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  37.62 
 
 		 311 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  35.19 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  33.85 
 
 		 313 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 311 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  40.62 
 
 		 293 aa  54.3  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  37.89 
 
 		 290 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  25.1 
 
 		 669 aa  54.3  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  31.87 
 
 		 350 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  24.22 
 
 		 305 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  29.05 
 
 		 694 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  36.26 
 
 		 734 aa  53.9  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  29.52 
 
 		 706 aa  53.9  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  29.52 
 
 		 706 aa  53.9  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  37.76 
 
 		 313 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  35.64 
 
 		 311 aa  53.9  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 315 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  35.42 
 
 		 283 aa  53.9  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  31.72 
 
 		 714 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  31.37 
 
 		 716 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  30.73 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 323 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  31.9 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 706 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 294 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  29.2 
 
 		 708 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  37.5 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.47 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  26.22 
 
 		 355 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  38.54 
 
 		 290 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>