More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1810 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 343 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.95 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  61.06 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  61.36 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.09 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.83 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.83 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.46 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.05 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.69 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.1 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  57.96 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  54.22 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  55.06 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.01 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.89 
 
 		 351 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.68 
 
 		 341 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  57 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.43 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.55 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.52 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.43 
 
 		 337 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.25 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.39 
 
 		 341 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.12 
 
 		 338 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.19 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.15 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.44 
 
 		 335 aa  271  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.83 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.52 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.22 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.97 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.99 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.83 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.16 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.08 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.63 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  52.6 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.74 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.3 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.31 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.26 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  41.88 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  38.14 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  38.14 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  37.98 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  39.22 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  38.46 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.72 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  38.68 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.93 
 
 		 490 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  39.22 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  38.19 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  38.41 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.75 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.86 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.93 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  40.08 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.49 
 
 		 363 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  40.08 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.21 
 
 		 517 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  37.72 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.02 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  38.19 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  36.05 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  38.79 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.21 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  38.79 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.11 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.11 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  38.63 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  38.18 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.42 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.24 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  37.82 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  39.1 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  38.79 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  40.78 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  37.76 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  36.36 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  37.41 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.85 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  38.43 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  36.77 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  38.16 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  34.88 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.55 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>