More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1510 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  64.22 
 
 		 534 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  64 
 
 		 538 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 544 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  100 
 
 		 539 aa  1078    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  64.35 
 
 		 534 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  61.86 
 
 		 534 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  62.41 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  62.12 
 
 		 540 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  57.3 
 
 		 545 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  58.49 
 
 		 585 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  56.71 
 
 		 547 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  57.36 
 
 		 545 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  57.55 
 
 		 546 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  56.25 
 
 		 549 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  56.55 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  56.02 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  56.93 
 
 		 552 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  57.65 
 
 		 550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  58.51 
 
 		 560 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  56.37 
 
 		 552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  55.18 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  56.17 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  54.89 
 
 		 553 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  55.6 
 
 		 552 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  54.55 
 
 		 550 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 548 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  55.66 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  53.99 
 
 		 541 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  54.27 
 
 		 552 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  56.73 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  54.17 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  52.92 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  51.98 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  53.38 
 
 		 556 aa  525  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  50.94 
 
 		 552 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  50.47 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  48.78 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.23 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  46.76 
 
 		 612 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.42 
 
 		 640 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 539 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  45.65 
 
 		 611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.11 
 
 		 617 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.11 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.62 
 
 		 624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.38 
 
 		 619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 627 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.84 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 625 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 625 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.46 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  46.98 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.08 
 
 		 562 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.73 
 
 		 637 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.54 
 
 		 623 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  48.45 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.57 
 
 		 615 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 633 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.83 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.63 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  45.98 
 
 		 633 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.44 
 
 		 547 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  46.45 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.47 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 632 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.59 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 649 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  44.84 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.71 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 629 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.26 
 
 		 630 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.1 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  46.1 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.83 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.15 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 601 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  41.44 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.32 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.16 
 
 		 568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.08 
 
 		 633 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.15 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.49 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 		 633 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.14 
 
 		 596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  45.34 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>