More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0160 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
428 aa  867    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  65.19 
 
 
428 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  64.95 
 
 
428 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  66.36 
 
 
428 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 
432 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 
436 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  64.24 
 
 
431 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  61.41 
 
 
427 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  54.67 
 
 
427 aa  482  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 
428 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 
433 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  45.84 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 
436 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
423 aa  302  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
453 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  37.17 
 
 
430 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  37.17 
 
 
430 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  37.17 
 
 
430 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.45 
 
 
430 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  40.44 
 
 
421 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
430 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
430 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.49 
 
 
430 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  38.8 
 
 
438 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
433 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
433 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
433 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
425 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
433 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 
437 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  37.44 
 
 
439 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  37.2 
 
 
437 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
429 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 
441 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
441 aa  249  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  37.74 
 
 
439 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 
435 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
433 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
430 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
434 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
429 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 
434 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
429 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
429 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  37.32 
 
 
468 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  36.54 
 
 
440 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
429 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
433 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
429 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  37.08 
 
 
468 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
429 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  34.13 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  36.84 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  37.22 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  34.1 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  36.97 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  37.71 
 
 
443 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
437 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
427 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  34.79 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
435 aa  233  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
430 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
434 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
439 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
433 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
437 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
434 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
434 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
430 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
419 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.56 
 
 
427 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
428 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.33 
 
 
427 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
427 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
427 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
435 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 
427 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 
427 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
428 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
426 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
427 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
435 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
428 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
428 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
428 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
427 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
435 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  37.17 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>