59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1315 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  627  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  48.25 
 
 
319 aa  288  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  43.18 
 
 
299 aa  245  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  37.9 
 
 
295 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  37.34 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  35.11 
 
 
299 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  34.19 
 
 
295 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 
301 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  30.99 
 
 
311 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  31.91 
 
 
302 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  32.75 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  31.23 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  30.48 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  27.09 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  28 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  26.22 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  26.27 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  28.24 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  28.71 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  35.92 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  29.71 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  26.92 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  29.15 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  22.78 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  30.71 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  29.71 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  28.57 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  25.51 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  28.3 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  28.34 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  25.56 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.9 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.9 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  30.93 
 
 
264 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  24.23 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.32 
 
 
1062 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.36 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  30.9 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  26.97 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  24.63 
 
 
366 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  25.73 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  24.14 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.32 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1217  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.85 
 
 
1157 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1088  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.85 
 
 
1157 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464939 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.08 
 
 
1057 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  26.15 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0672  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.72 
 
 
1107 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.715776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  26.15 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.72 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  28.1 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  20 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  29.89 
 
 
484 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  24.62 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  31.34 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.15 
 
 
1496 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  29.53 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>