37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0187 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  58.75 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  43.67 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  42.77 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  43.21 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  42.24 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  47.15 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  47.15 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  43.71 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  46.34 
 
 		 159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  39.76 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  40.51 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  42.59 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  42.41 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  38.71 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  37.89 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  37.65 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  46.34 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  43.86 
 
 		 151 aa  90.9  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  32.76 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  46.25 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  34.81 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  31.95 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  33.11 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  33.68 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  34.23 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  28.4 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  33.33 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  30.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  39.51 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  26.32 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.06 
 
 		 194 aa  50.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  32.17 
 
 		 633 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.66 
 
 		 580 aa  45.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  29.41 
 
 		 466 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  28.8 
 
 		 564 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>