36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2236 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  815    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  50.13 
 
 
405 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  43.63 
 
 
408 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  40.94 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  47.15 
 
 
402 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  30.14 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.64 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  30.57 
 
 
427 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.75 
 
 
466 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.8 
 
 
459 aa  133  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.8 
 
 
461 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  28.12 
 
 
492 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  23.98 
 
 
432 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  25.62 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  26.25 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  29.26 
 
 
473 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 
469 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  24.52 
 
 
431 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  27.68 
 
 
469 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  25.54 
 
 
431 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.57 
 
 
420 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  24.25 
 
 
477 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  24.29 
 
 
473 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  32.92 
 
 
515 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  24.35 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  25.66 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  25.73 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  29.46 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  21.55 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  25.16 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  30.38 
 
 
466 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  24.79 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  23.43 
 
 
467 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.06 
 
 
574 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  23.43 
 
 
467 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  24.07 
 
 
467 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>