234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1457 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  63.12 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  45.83 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  45.08 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  43.61 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  47.01 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  38.97 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  50.43 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  38.52 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.1 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  61.33 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  40.32 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  34.62 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.02 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  38.52 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  39.37 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  39.34 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  34.9 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  34.4 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  38.66 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  34.23 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  34.21 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.65 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  33.05 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  35.45 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  34.19 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  39.47 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  39.68 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  39.68 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.82 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  37.3 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  39.68 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  36.36 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  32.74 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  32.74 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.09 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.79 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  32.43 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  35.77 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  30.88 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  32.73 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  47.95 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  30 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  34.23 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  34.62 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.64 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  34.62 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.93 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  37.84 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.43 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.02 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  37.14 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.89 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  28.57 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.97 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  29.91 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>