225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0527 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  100 
 
 
462 aa  949    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  53.07 
 
 
461 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  51.2 
 
 
468 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.75 
 
 
451 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.2 
 
 
450 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  48.92 
 
 
459 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.88 
 
 
469 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  48.92 
 
 
447 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  47.33 
 
 
495 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46 
 
 
473 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.49 
 
 
452 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  48.62 
 
 
506 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  47.17 
 
 
487 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.36 
 
 
494 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.35 
 
 
449 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  41.31 
 
 
511 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  43.01 
 
 
477 aa  356  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  43.01 
 
 
477 aa  356  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.63 
 
 
466 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.15 
 
 
455 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.39 
 
 
448 aa  339  5e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  40.04 
 
 
464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  40.05 
 
 
446 aa  319  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  40.51 
 
 
453 aa  312  7.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.88 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.7 
 
 
462 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  38.27 
 
 
468 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  38.23 
 
 
467 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.04 
 
 
476 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.28 
 
 
465 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.72 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.58 
 
 
467 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.5 
 
 
467 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.82 
 
 
490 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  32.98 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  32.99 
 
 
486 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  32.59 
 
 
486 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  32.13 
 
 
496 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  31.79 
 
 
490 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  32.77 
 
 
493 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.91 
 
 
843 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  53.06 
 
 
104 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  48.75 
 
 
114 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  25.53 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  25.57 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.32 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.51 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  31.52 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.93 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.24 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  23.24 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.98 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.53 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.48 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.26 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.92 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.66 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.68 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.85 
 
 
476 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.83 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.02 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.42 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.42 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.42 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.42 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.63 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.68 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.71 
 
 
481 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.62 
 
 
499 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.82 
 
 
479 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.63 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.35 
 
 
479 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.95 
 
 
474 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.16 
 
 
479 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.42 
 
 
483 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.43 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1815  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.06 
 
 
486 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
486 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.06 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  28.12 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.06 
 
 
519 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.06 
 
 
519 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.28 
 
 
449 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.57 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.94 
 
 
493 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.83 
 
 
518 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.17 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.22 
 
 
511 aa  60.1  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  28.02 
 
 
479 aa  60.1  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.33 
 
 
454 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.68 
 
 
504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  23.04 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.26 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.26 
 
 
499 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.8 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.3 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.31 
 
 
497 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.89 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.48 
 
 
483 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.81 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>