22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0237 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  48.75 
 
 		 462 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  46.67 
 
 		 495 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.42 
 
 		 451 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  36.17 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  42.67 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.24 
 
 		 447 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.19 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  44.44 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.27 
 
 		 450 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.31 
 
 		 468 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  41.33 
 
 		 506 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.63 
 
 		 494 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.14 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  40 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.89 
 
 		 452 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.36 
 
 		 449 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  49.02 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.7 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.33 
 
 		 464 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.62 
 
 		 456 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  41.18 
 
 		 468 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>