47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1531 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 
104 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  66.34 
 
 
103 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  66 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  66 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  63.37 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  63.37 
 
 
105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  63.37 
 
 
105 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  63.37 
 
 
105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  62.38 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  62.38 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  60.4 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  54.9 
 
 
104 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  53.92 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  53.12 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  35.24 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  41.76 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  39.56 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  31.73 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  31.73 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  35 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  31.17 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
913 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  32.04 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
710 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 
229 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  32.35 
 
 
373 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  28.43 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  25 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  31.19 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  31.19 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  30.28 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  32 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  43.14 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  29.81 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  24.51 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  43.14 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  33.72 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  45.83 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.45 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  27.45 
 
 
376 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  27.94 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  29 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3434  hypothetical protein  23.21 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  29 
 
 
375 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>