83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1172 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1379  hypothetical protein  34.65 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0373776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  35.22 
 
 
228 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  33.04 
 
 
226 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  49.09 
 
 
575 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  48.44 
 
 
573 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
554 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  45.45 
 
 
574 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.89 
 
 
558 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
559 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  45.45 
 
 
574 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  41.07 
 
 
562 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  41.07 
 
 
563 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
561 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
578 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
570 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.83 
 
 
553 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  42.37 
 
 
1141 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  44.23 
 
 
356 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  41.82 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.86 
 
 
555 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  29.84 
 
 
570 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  40 
 
 
547 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.38 
 
 
891 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  50 
 
 
553 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
577 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
624 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
584 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
553 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
585 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  39.66 
 
 
569 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
554 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  43.64 
 
 
586 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
561 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
612 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  37.66 
 
 
585 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
574 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  41.82 
 
 
637 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  28.33 
 
 
558 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.3 
 
 
568 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  39.62 
 
 
567 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  46.3 
 
 
568 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.6 
 
 
589 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  47.83 
 
 
491 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  45.45 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  46 
 
 
577 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  41.82 
 
 
587 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
566 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  46.3 
 
 
345 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  25.86 
 
 
564 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  47.27 
 
 
367 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
787 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  46.3 
 
 
345 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.38 
 
 
561 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.86 
 
 
571 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
888 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.1 
 
 
885 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  45.45 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  38.89 
 
 
366 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0948  hypothetical protein  33.96 
 
 
65 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  38.89 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39.29 
 
 
582 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  35 
 
 
2725 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  38.89 
 
 
366 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0921  hypothetical protein  33.96 
 
 
65 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  38.98 
 
 
575 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  36.92 
 
 
644 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  29.63 
 
 
638 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.93 
 
 
568 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  38.89 
 
 
387 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  38.89 
 
 
391 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  41.82 
 
 
573 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  38.18 
 
 
586 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.89 
 
 
566 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  40 
 
 
578 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.07 
 
 
698 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  33.78 
 
 
577 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  46.3 
 
 
575 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  25.64 
 
 
552 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  36.21 
 
 
573 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  33.93 
 
 
577 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>