37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0921 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0948  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0921  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0431  hypothetical protein  67.69 
 
 
65 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
567 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
566 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  49.06 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.74 
 
 
888 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.62 
 
 
698 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1379  hypothetical protein  45.28 
 
 
240 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0373776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  45.28 
 
 
228 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.51 
 
 
570 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
885 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.62 
 
 
703 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.62 
 
 
703 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  36.36 
 
 
1017 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1172  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  33.96 
 
 
247 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
585 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
573 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
563 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
340 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
573 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  36.54 
 
 
552 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  36.54 
 
 
1141 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38 
 
 
561 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.62 
 
 
871 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  38.89 
 
 
841 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
564 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  40 
 
 
621 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
561 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  31.48 
 
 
571 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  39.62 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
891 aa  40  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
574 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.07 
 
 
568 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
569 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>