29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0431 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0431  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0921  hypothetical protein  67.69 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0948  hypothetical protein  67.69 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1379  hypothetical protein  51.92 
 
 		 240 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0373776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  51.92 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  37.74 
 
 		 574 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  43.4 
 
 		 569 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  41.51 
 
 		 576 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  34.62 
 
 		 552 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.38 
 
 		 570 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.54 
 
 		 703 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.54 
 
 		 703 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  43.4 
 
 		 567 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 573 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  39.62 
 
 		 573 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.62 
 
 		 566 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  42.31 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  41.51 
 
 		 566 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  40.38 
 
 		 345 aa  42  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  41.38 
 
 		 1141 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.46 
 
 		 698 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  46.51 
 
 		 168 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.55 
 
 		 568 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 585 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.18 
 
 		 568 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 547 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>