More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2655 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  100 
 
 		 421 aa  857    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  81.48 
 
 		 411 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  88.51 
 
 		 425 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  83.25 
 
 		 421 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  49.01 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  48.63 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  47.56 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  45.43 
 
 		 421 aa  354  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.19 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  42.49 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  41.65 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  41.16 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  40.57 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.91 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.06 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  40.1 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  40.37 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  40.14 
 
 		 448 aa  282  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  40.19 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  42.22 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  41.98 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  39.95 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  39.95 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.81 
 
 		 488 aa  269  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  42.44 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.05 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  38.84 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  60.7 
 
 		 222 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.41 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  36.57 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  34.84 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.43 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  39.86 
 
 		 684 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  55.38 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  69.75 
 
 		 247 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  31.64 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  53.33 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  56.3 
 
 		 183 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  52.74 
 
 		 196 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  86.08 
 
 		 82 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  53.96 
 
 		 200 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  49.64 
 
 		 203 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  50 
 
 		 178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  51.95 
 
 		 184 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.35 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  46.62 
 
 		 169 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  54.37 
 
 		 177 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  50.36 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  42.14 
 
 		 212 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  42.52 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  54.32 
 
 		 87 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  56.94 
 
 		 77 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.8 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  39.29 
 
 		 196 aa  86.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  56.94 
 
 		 131 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  38.71 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.94 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.85 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  28.63 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  28.76 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  28.15 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  25.76 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.78 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  26.12 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 		 271 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.89 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.73 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.73 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  26.56 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  26.12 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  26.12 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  26.12 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  26.12 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  26.12 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.71 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.89 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  25.31 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.14 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.46 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.21 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.9 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.02 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  29.22 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.55 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  29.22 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.38 
 
 		 225 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.36 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.67 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.41 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.96 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.26 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.75 
 
 		 94 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.75 
 
 		 94 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.41 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.69 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.03 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>