105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2563 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  50 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  50.65 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  50.22 
 
 
240 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  50 
 
 
240 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  49.12 
 
 
240 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  43.51 
 
 
246 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  45.69 
 
 
239 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  45.02 
 
 
262 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0306  hypothetical protein  52.67 
 
 
133 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0336  hypothetical protein  51.15 
 
 
133 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  32.43 
 
 
268 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.47 
 
 
244 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  47.46 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  46.55 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  45.76 
 
 
634 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  44 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
706 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
228 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  48 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.77 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.29 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  43.86 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  44 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  50 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
241 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
223 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  44 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
264 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
238 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
295 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  48 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  45.1 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  42.37 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  46.2  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
711 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
511 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
710 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  50.94 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  43.75 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  51.22 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4110  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.11 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  37.74 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  35.59 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
853 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.29 
 
 
870 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  25.64 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
750 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.91 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  37.29 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.8 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  55.26 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.36 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  31.96 
 
 
213 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 
211 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  43.48 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  44.9 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  23.26 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  42.55 
 
 
228 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
257 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
256 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  41.82 
 
 
1124 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>