More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03779 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  100 
 
 
410 aa  852    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.89 
 
 
397 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.65 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.25 
 
 
396 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
403 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
373 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
570 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
396 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  32.75 
 
 
414 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5747  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
417 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00131351  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2158  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
414 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
415 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2174  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  36.87 
 
 
684 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
392 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
684 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
621 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  33.84 
 
 
373 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  39.87 
 
 
166 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4542  GAF domain protein  38.61 
 
 
166 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  32.89 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
618 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  32.89 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  32.89 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  32.94 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  30.5 
 
 
373 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  31.14 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  32.82 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  32.82 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
377 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  32.51 
 
 
728 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
734 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
442 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  30.45 
 
 
373 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  33.05 
 
 
728 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  36.16 
 
 
376 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
382 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  30.34 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
1084 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  31.12 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  31.66 
 
 
380 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
460 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  29.57 
 
 
375 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
393 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  33.8 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  31.62 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
408 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  29.6 
 
 
395 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  29.37 
 
 
447 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.05 
 
 
393 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  30.98 
 
 
678 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2483  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
384 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
405 aa  106  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
408 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1460  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 
341 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
391 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
384 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 
643 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  26.05 
 
 
542 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
395 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  37.59 
 
 
643 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  27.38 
 
 
364 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
590 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  27.16 
 
 
501 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
912 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
662 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  27.62 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
646 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 
1965 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  33.33 
 
 
209 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1070 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
625 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  29.69 
 
 
565 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
763 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
461 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.23 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  27.21 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  29.08 
 
 
356 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
763 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  30.13 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>