More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1460 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1460  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
341 aa  694    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119826  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0532  histidine kinase  49.32 
 
 
237 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  31.3 
 
 
356 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
356 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
888 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
889 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  35.5 
 
 
885 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
892 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
530 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.19 
 
 
539 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  33.78 
 
 
530 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
890 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  31.8 
 
 
910 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
902 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
895 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
522 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  34.98 
 
 
497 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  34.62 
 
 
895 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
894 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  34.89 
 
 
895 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
894 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
894 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  34.62 
 
 
894 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
894 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
894 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2380  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
568 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56794  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  34.62 
 
 
894 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
907 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
902 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  33.76 
 
 
894 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  33.76 
 
 
894 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
938 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
905 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.65 
 
 
938 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  33.76 
 
 
894 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.03 
 
 
895 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  33.76 
 
 
894 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
949 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  33.61 
 
 
993 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
579 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  33.61 
 
 
954 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  33.61 
 
 
954 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  33.61 
 
 
993 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  33.61 
 
 
993 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
905 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
897 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  31.09 
 
 
905 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  30.96 
 
 
937 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  33.91 
 
 
907 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  30.33 
 
 
906 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  32.46 
 
 
897 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
951 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
907 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  32.24 
 
 
905 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
348 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  28.05 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  31.09 
 
 
915 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3503  histidine kinase  27.17 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  31.86 
 
 
488 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
901 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
897 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
348 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
945 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0060  ATPase domain-containing protein  26.85 
 
 
348 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
945 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
348 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
453 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
895 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
896 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
951 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
967 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
947 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
897 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.44 
 
 
1035 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
496 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
899 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
902 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
894 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
947 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
381 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
947 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
947 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
907 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
944 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  30.26 
 
 
908 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  30.04 
 
 
909 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
887 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  27.37 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
884 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
887 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
944 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  31.25 
 
 
905 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
884 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  29.46 
 
 
910 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
897 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>