138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5219 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  89.86 
 
 
296 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  73.87 
 
 
300 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  72.54 
 
 
298 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  72.2 
 
 
298 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  72.6 
 
 
298 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  57.39 
 
 
295 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  58.74 
 
 
295 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  57.29 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  57.34 
 
 
295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  59.09 
 
 
294 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  55.97 
 
 
295 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  58.05 
 
 
321 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  54.51 
 
 
295 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  59.42 
 
 
298 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  60.97 
 
 
293 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  57.76 
 
 
296 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  57.76 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  56.29 
 
 
295 aa  319  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  56.88 
 
 
293 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  58.75 
 
 
293 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  57.04 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  55.47 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  53.87 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  56.62 
 
 
340 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  51.82 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  53.31 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  50.91 
 
 
293 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  47.57 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  49.4 
 
 
319 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  46.4 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  46.04 
 
 
286 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  46.76 
 
 
285 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  45.49 
 
 
287 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  44.56 
 
 
287 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  46.48 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  44.88 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  41.11 
 
 
296 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  36.63 
 
 
286 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  40.5 
 
 
297 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  37.4 
 
 
281 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  38.41 
 
 
292 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  40.14 
 
 
297 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  39.25 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  39.25 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  37.6 
 
 
310 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  37.59 
 
 
290 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  39.07 
 
 
301 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  38.43 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  34.95 
 
 
299 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  34.67 
 
 
284 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  36.4 
 
 
302 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  36.4 
 
 
302 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  36.4 
 
 
302 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 
302 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 
302 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 
302 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  35.44 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  36.17 
 
 
291 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  33.22 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  33.76 
 
 
270 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
270 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  34.27 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  32.04 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  31.69 
 
 
271 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.66 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.87 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.43 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  33.33 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  31.22 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  30.26 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  29.46 
 
 
266 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  32.54 
 
 
287 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  31.71 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 
270 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  32.48 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  30.64 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  31.17 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  32.34 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  29.26 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
270 aa  89  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.82 
 
 
266 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.47 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.69 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  30.65 
 
 
271 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  29.52 
 
 
268 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 
271 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  31.03 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  31.73 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>