More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5142 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5142  4-phytase  100 
 
 		 531 aa  1035    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  56.56 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  54.93 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  57.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.94 
 
 		 541 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  34.32 
 
 		 524 aa  273  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.56 
 
 		 535 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 544 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 565 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.4 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.94 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 547 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.65 
 
 		 516 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.75 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  32.82 
 
 		 531 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.65 
 
 		 516 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  32.81 
 
 		 533 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.65 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.45 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.45 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.45 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  34.44 
 
 		 519 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 535 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 		 516 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.26 
 
 		 526 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  30.65 
 
 		 516 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.26 
 
 		 526 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 535 aa  236  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  37.02 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  30.29 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  33.53 
 
 		 532 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31.15 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  31.32 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  34.07 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 508 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  31.51 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 538 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.58 
 
 		 530 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 531 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 520 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 520 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.19 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  31.75 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  30.19 
 
 		 535 aa  224  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.4 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  30.19 
 
 		 535 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.19 
 
 		 535 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.32 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  30.93 
 
 		 533 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.03 
 
 		 542 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 542 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.32 
 
 		 521 aa  223  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.32 
 
 		 521 aa  223  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.32 
 
 		 521 aa  223  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 521 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 512 aa  223  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.8 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  30.8 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 537 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.02 
 
 		 542 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.18 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 544 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  30.58 
 
 		 523 aa  220  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 523 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  29.13 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 		 589 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>