237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4286 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  66.13 
 
 		 499 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  967    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.87 
 
 		 502 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  64.42 
 
 		 497 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  57.78 
 
 		 504 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  56.75 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  52.79 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  54.88 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  40.92 
 
 		 494 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  40.37 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  39.62 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  39.62 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.07 
 
 		 493 aa  306  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.31 
 
 		 514 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.39 
 
 		 503 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  39.92 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  36.54 
 
 		 506 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  37.9 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.91 
 
 		 516 aa  296  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.1 
 
 		 514 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  39.96 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  39.96 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  36.57 
 
 		 499 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  34.64 
 
 		 499 aa  289  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.15 
 
 		 491 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  35.27 
 
 		 502 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  35.86 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.62 
 
 		 503 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.1 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  35.27 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  35.96 
 
 		 496 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  36.61 
 
 		 658 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.18 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 658 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  33.62 
 
 		 502 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.18 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.83 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  37.3 
 
 		 500 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  37.27 
 
 		 529 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  34.55 
 
 		 529 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.79 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  35.58 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  33.47 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  32.71 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.19 
 
 		 531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.93 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  32.93 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  32.93 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.93 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  37.18 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  32.72 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.71 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  34.77 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  35.74 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  34.99 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.34 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  34.12 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  35.52 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.4 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.16 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  35.71 
 
 		 503 aa  252  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.67 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  35.07 
 
 		 508 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.73 
 
 		 497 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  32.36 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.63 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  33.54 
 
 		 504 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  34.04 
 
 		 506 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  33.41 
 
 		 503 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  34.68 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  34.51 
 
 		 504 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  32.42 
 
 		 505 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.21 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  32.06 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  32.06 
 
 		 502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  33.47 
 
 		 509 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.89 
 
 		 536 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.7 
 
 		 501 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  34.69 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  31.78 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.48 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.65 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.85 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  31.64 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  31.89 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.38 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  34.29 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  33.04 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  33.93 
 
 		 502 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  32.1 
 
 		 504 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  33.97 
 
 		 505 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>