61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3018 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  92.22 
 
 		 167 aa  308  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  87.12 
 
 		 180 aa  286  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  85.89 
 
 		 180 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  84.85 
 
 		 177 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  88.82 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  82.61 
 
 		 167 aa  270  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  83.77 
 
 		 168 aa  268  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.31 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  76 
 
 		 172 aa  241  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  74.07 
 
 		 172 aa  240  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  74.07 
 
 		 162 aa  238  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  75.46 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  70.25 
 
 		 169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.61 
 
 		 171 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  71.79 
 
 		 156 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  79.87 
 
 		 161 aa  228  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.26 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.61 
 
 		 157 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  68 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.56 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 139 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  41.23 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  37.82 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  35.85 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  37.1 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  31.07 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  32.58 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  27.69 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  34.19 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.86 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  31.88 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  29.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  29.73 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.15 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 118 aa  41.2  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  27.83 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 288 aa  40.8  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>