More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2876 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 612 aa  1172    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 		 645 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 		 601 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 		 605 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 		 620 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 		 647 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 616 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.22 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 602 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  41.95 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 509 aa  347  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.16 
 
 		 610 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.76 
 
 		 610 aa  289  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 633 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 607 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 603 aa  279  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 580 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  34.94 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 604 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 604 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 604 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 600 aa  270  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 605 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 596 aa  266  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 637 aa  257  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 595 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.66 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 609 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 597 aa  250  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 607 aa  250  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 606 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 602 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 630 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 602 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 599 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 601 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  30.74 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 600 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 590 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 597 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  30.12 
 
 		 618 aa  244  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 601 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 601 aa  244  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  32.32 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 619 aa  242  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 607 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 601 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 601 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 590 aa  239  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  32.74 
 
 		 600 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 601 aa  238  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  31.27 
 
 		 607 aa  237  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 602 aa  237  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  30.38 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 597 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 611 aa  233  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>