More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0399 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  51.35 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  52.82 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  48.65 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  48.65 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  48.65 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  55.38 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  48.65 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  47.97 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  44 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  47.22 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40.54 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40.54 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  44.52 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  43.14 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  45.75 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.66 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  43.57 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  42.22 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  43.14 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.97 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  42.18 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.36 
 
 		 187 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  41.43 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  41.43 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  45.77 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  46.9 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  38.26 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.11 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  40.97 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  41.18 
 
 		 152 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  43.87 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  47.33 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  46.72 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  38.56 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  45.21 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.93 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.39 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  42.38 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  44.53 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  44.36 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.28 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.34 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  52.25 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.19 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  44.53 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  36.88 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  41.79 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  39.85 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.79 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.75 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  43.18 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.23 
 
 		 174 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.94 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  45.19 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.32 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  41.38 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.98 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  38.03 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  45.05 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  37.09 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  39.17 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  36.67 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  37.67 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  41.23 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  38.69 
 
 		 158 aa  90.1  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  40.74 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  36.6 
 
 		 503 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  43 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  45.67 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  38.52 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  35.86 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  40.74 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  38.78 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>