37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1207 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  99.56 
 
 		 711 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  40.38 
 
 		 735 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  40.38 
 
 		 735 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 815 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 765 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 841 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  27.18 
 
 		 760 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  28.38 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 691 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 738 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 835 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 738 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  19.88 
 
 		 736 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 747 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 729 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 799 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 792 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 740 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 753 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 828 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 791 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  27.96 
 
 		 766 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  26.23 
 
 		 652 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 746 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 760 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 824 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 799 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 718 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.32 
 
 		 768 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 781 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 777 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 799 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 655 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 768 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>