87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0199 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  65.29 
 
 		 120 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  67.77 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  67.77 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  59.5 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  59.5 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  35.09 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 538 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 504 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 537 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 537 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  35.45 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  33.07 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  35.79 
 
 		 546 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  42.65 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.68 
 
 		 517 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  41.79 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.68 
 
 		 512 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  35.92 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  30.77 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  26.32 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  37.14 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  27.73 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  36.11 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  33.02 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 513 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  26.32 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  27.91 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  27.42 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  37.18 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  32.38 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  48.98 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  48.98 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  48.98 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  44 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 		 502 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  48.08 
 
 		 523 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  29.79 
 
 		 629 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  29.21 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 483 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  33.85 
 
 		 672 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  28.99 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  28.26 
 
 		 509 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  32.35 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  25 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  42  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  29.11 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 510 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 545 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  30.3 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  29.41 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  29.41 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  28.18 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  28 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  27.78 
 
 		 571 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  30.16 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  27.36 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  33.33 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32.81 
 
 		 490 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  30.99 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  27.94 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  20.39 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>