More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1500 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 		 573 aa  1172    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  51.24 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  51.24 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  52.94 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 568 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  51.15 
 
 		 568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 558 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  47.36 
 
 		 593 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  47.02 
 
 		 579 aa  548  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.86 
 
 		 562 aa  537  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 		 569 aa  532  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  51.28 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  43.79 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.23 
 
 		 590 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 566 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 566 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.68 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 566 aa  485  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.11 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.87 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.29 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.37 
 
 		 548 aa  296  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  32.28 
 
 		 576 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.2 
 
 		 568 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.08 
 
 		 574 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 630 aa  270  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.2 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.86 
 
 		 526 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.17 
 
 		 541 aa  256  7e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.68 
 
 		 569 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.96 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.68 
 
 		 569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.6 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.43 
 
 		 497 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 627 aa  249  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  32.17 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.89 
 
 		 581 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.62 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.13 
 
 		 531 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.24 
 
 		 518 aa  239  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.56 
 
 		 501 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.8 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.38 
 
 		 495 aa  238  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  30.39 
 
 		 585 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.11 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.3 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.17 
 
 		 512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  28.22 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29 
 
 		 530 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.01 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.17 
 
 		 581 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  26.2 
 
 		 641 aa  230  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.62 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  27.01 
 
 		 571 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  27.97 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 		 489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 		 551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  29.36 
 
 		 500 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 551 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  25.93 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 		 553 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 647 aa  217  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 		 470 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 551 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  28.38 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.11 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.9 
 
 		 469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.92 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  27.8 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  26.57 
 
 		 547 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.91 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  29.21 
 
 		 539 aa  206  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.47 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  26.46 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.88 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.75 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  27.83 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.76 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.91 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  26.53 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  30.63 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  24.95 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>