More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0432 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  32.24 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  32.37 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  33.91 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.53 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 716 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  31.02 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  31.02 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.02 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 568 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 716 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  29.2 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 549 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  28.07 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 356 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 768 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  28.92 
 
 		 537 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 718 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  28.57 
 
 		 756 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  26.04 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  28.81 
 
 		 792 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 538 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 889 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 370 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  26.41 
 
 		 569 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  26.41 
 
 		 569 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  28.9 
 
 		 771 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  30.93 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 911 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  31.36 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  22.71 
 
 		 550 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 334 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 350 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 658 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  27.32 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 693 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 753 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 822 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 822 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 822 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  27.45 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  27.45 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 787 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 342 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0964  MscS mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  29.78 
 
 		 599 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 762 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  26.94 
 
 		 884 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 858 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  31.55 
 
 		 767 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 821 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  23.55 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  22.34 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>