More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0688 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 566 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 567 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 577 aa  677    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 567 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 570 aa  683    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1162    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 620 aa  627  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1913  prolyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 617 aa  621  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2432  prolyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 567 aa  594  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 570 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 572 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 570 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 568 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 569 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 574 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 566 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 572 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 572 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 572 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 571 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 572 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 574 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 572 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  47.74 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 572 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 572 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 570 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 570 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 570 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 571 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 572 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 572 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 572 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 572 aa  528  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 568 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 570 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 580 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 571 aa  525  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 570 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 571 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 571 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 571 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 572 aa  518  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 574 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 584 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>