121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2466 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 406 aa  816    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  35.22 
 
 		 418 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  31.6 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  30.02 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  30.52 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  30.52 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  30.52 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  30.27 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  30.37 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  27.39 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  24.12 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  22.14 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.44 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.43 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.53 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.48 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.16 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.8 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06064  hypothetical protein  24.31 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.7 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.62 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  24.93 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.39 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.15 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  22.79 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  20.85 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  20.89 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  21.11 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  21.11 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.11 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  24.54 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  24.54 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.54 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  20.99 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.11 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  23.05 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  21.39 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  19.75 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.27 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  20.83 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  20.45 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  21.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  21.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.53 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  21.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  21.22 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  21.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  21.22 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  24.73 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>