More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1148 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  100 
 
 
979 aa  2023    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1761  hypothetical protein  83.37 
 
 
929 aa  1608    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1849  phage minor structural protein  35.16 
 
 
466 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0322579  normal  0.615795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2593  phage minor structural protein  32.4 
 
 
855 aa  124  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  50.41 
 
 
402 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.29 
 
 
377 aa  106  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  38.71 
 
 
399 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.71 
 
 
399 aa  105  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  48.28 
 
 
538 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.8 
 
 
431 aa  100  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.38 
 
 
441 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.67 
 
 
411 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  45.08 
 
 
541 aa  97.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.22 
 
 
376 aa  97.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  40 
 
 
341 aa  97.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  47.15 
 
 
529 aa  96.3  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.15 
 
 
417 aa  94.7  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.34 
 
 
282 aa  94.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.38 
 
 
288 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.81 
 
 
343 aa  93.2  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.92 
 
 
524 aa  93.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  38.31 
 
 
400 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  42.86 
 
 
301 aa  92.8  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  38.17 
 
 
290 aa  92.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  36.84 
 
 
216 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.64 
 
 
303 aa  91.7  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  42.61 
 
 
470 aa  91.3  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  44.17 
 
 
523 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  36.96 
 
 
327 aa  91.3  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.22 
 
 
372 aa  90.9  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44.86 
 
 
527 aa  90.9  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  34.97 
 
 
412 aa  90.9  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.31 
 
 
296 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  44.09 
 
 
334 aa  90.5  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  44.54 
 
 
460 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.62 
 
 
375 aa  90.1  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.18 
 
 
379 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  35.94 
 
 
295 aa  89.7  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  41.27 
 
 
439 aa  90.1  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  36.89 
 
 
316 aa  89.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  41.73 
 
 
341 aa  89.7  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  37.4 
 
 
316 aa  89.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.52 
 
 
314 aa  89  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.67 
 
 
379 aa  89  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  41.9 
 
 
300 aa  89  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  47.83 
 
 
336 aa  88.6  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  46 
 
 
468 aa  88.6  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  39.16 
 
 
379 aa  88.6  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  41.9 
 
 
300 aa  88.2  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  40.52 
 
 
374 aa  88.6  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  46 
 
 
468 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  46 
 
 
468 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  36.03 
 
 
319 aa  88.2  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  46 
 
 
468 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.58 
 
 
274 aa  87.8  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  46 
 
 
468 aa  87.8  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  39.86 
 
 
268 aa  87.8  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  46 
 
 
466 aa  87.8  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  38.56 
 
 
443 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  42.86 
 
 
307 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  40 
 
 
404 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  42.61 
 
 
475 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40 
 
 
377 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  37.18 
 
 
309 aa  87.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  42.24 
 
 
137 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  38.46 
 
 
328 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  40.15 
 
 
318 aa  87.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  41.74 
 
 
491 aa  87  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  41.43 
 
 
390 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.32 
 
 
303 aa  86.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.68 
 
 
324 aa  87  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  45.69 
 
 
353 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  40.16 
 
 
319 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  36.03 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.89 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  43.1 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.3 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  44 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  44 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  45 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  35 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  39.32 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  43.86 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  39.53 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  42.61 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  44 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  40.37 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  43 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  41.28 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  35.92 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.19 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  43.33 
 
 
687 aa  85.1  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  40.87 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  37.88 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  41.9 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.86 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  39.17 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  39.84 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  37.7 
 
 
241 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  40.68 
 
 
443 aa  84  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>