36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2593 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2593  phage minor structural protein  100 
 
 
855 aa  1759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1849  phage minor structural protein  57.27 
 
 
466 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0322579  normal  0.615795 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2638  phage minor structural protein  32.36 
 
 
730 aa  207  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0220022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1144  phage tail fiber protein  31.46 
 
 
1239 aa  200  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.305507  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  33.07 
 
 
2196 aa  194  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13990  hypothetical protein  34.25 
 
 
341 aa  140  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1761  hypothetical protein  32.8 
 
 
929 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  32.4 
 
 
979 aa  125  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2402  structural protein  25.25 
 
 
1524 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00631563  normal  0.821189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1391  minor structural protein  28.62 
 
 
1439 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000302935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2686  phage minor structural protein  25.54 
 
 
1544 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2933  phage minor structural protein  25.25 
 
 
1496 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0509957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2584  phage minor structural protein  25.56 
 
 
1341 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0192234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1616  phage minor structural protein  30.03 
 
 
840 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2823  phage minor structural protein  28.81 
 
 
839 aa  111  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2250  minor structural protein  25.56 
 
 
1341 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.069848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0673  phage minor structural protein  24 
 
 
1585 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3414  phage minor structural protein  27.62 
 
 
2399 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3411  phage-related protein; prophage LambdaBa01, minor structural protein  26.71 
 
 
1625 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3579  phage minor structural protein  24.28 
 
 
1564 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.790906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3494  prophage LambdaBa01, minor structural protein  27.08 
 
 
883 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2634  minor structural protein  27.27 
 
 
1343 aa  105  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4078  phage minor structural protein  25.81 
 
 
660 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3789  phage minor structural protein  25.81 
 
 
660 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5851  hypothetical protein  23.66 
 
 
1986 aa  102  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1265  phage minor structural protein  25.2 
 
 
840 aa  96.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2008  phage minor structural protein  24.29 
 
 
1261 aa  89.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2044  phage minor structural protein  24.29 
 
 
1261 aa  89.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1707  phage minor structural protein  22.51 
 
 
634 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0599  phage endopeptidase  24.42 
 
 
807 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1853  hypothetical protein  27.54 
 
 
929 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.335277  normal  0.937795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  22.42 
 
 
1019 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2141  hypothetical protein  33.59 
 
 
166 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.313599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0481  phage minor structural protein  24.07 
 
 
544 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0457  phage minor structural protein  24.07 
 
 
544 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0598  prophage LambdaSa1, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein  30.34 
 
 
1374 aa  45.8  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>