287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0429 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
680 aa  1363    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  44.76 
 
 
688 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  43.78 
 
 
689 aa  569  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
692 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
692 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  30.77 
 
 
679 aa  221  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
667 aa  214  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 
563 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 
563 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 
563 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 
563 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  30.18 
 
 
548 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
548 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  29.87 
 
 
666 aa  204  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 
555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 
548 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
549 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  34.49 
 
 
770 aa  194  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 
666 aa  192  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  30.02 
 
 
654 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 
555 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  29.93 
 
 
548 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  28.68 
 
 
551 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 
633 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 
555 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  29.91 
 
 
549 aa  187  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 
555 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.71 
 
 
555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 
548 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 
549 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.82 
 
 
551 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  29.21 
 
 
566 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 
566 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
547 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.01 
 
 
690 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 
549 aa  179  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  28.42 
 
 
546 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 
549 aa  179  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 
549 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 
554 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 
545 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 
631 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.6 
 
 
553 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  34.3 
 
 
581 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
585 aa  170  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
555 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
555 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 
560 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 
548 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 
546 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  31.92 
 
 
543 aa  160  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 
548 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 
757 aa  157  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 
577 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  29.37 
 
 
566 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  29.37 
 
 
548 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 
545 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.45 
 
 
705 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 
527 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  26.8 
 
 
524 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11700  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  35.42 
 
 
775 aa  151  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.273812 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.34 
 
 
525 aa  150  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 
548 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 
524 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
653 aa  144  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  27.03 
 
 
624 aa  143  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.96 
 
 
698 aa  143  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.91 
 
 
695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.87 
 
 
537 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  25.63 
 
 
531 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  29.19 
 
 
531 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.43 
 
 
577 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.22 
 
 
527 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 
528 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.78 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
425 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.72 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  33.22 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  27.86 
 
 
536 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  27.78 
 
 
532 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  25.67 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 
624 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  27.31 
 
 
535 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 
537 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
526 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
526 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 
526 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>