More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  100 
 
 		 448 aa  884    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  37 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.41 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  37.4 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.36 
 
 		 497 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.28 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 		 573 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  36.62 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.69 
 
 		 374 aa  134  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.27 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.51 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.57 
 
 		 625 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.27 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.35 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  38.22 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.12 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.07 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.07 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  31.77 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.07 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.23 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.85 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.1 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.47 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.8 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.78 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  38.37 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.89 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.15 
 
 		 365 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.37 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.26 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.8 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  29.63 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.21 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.22 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 		 618 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.42 
 
 		 434 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.27 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.49 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.96 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.41 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.89 
 
 		 619 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.75 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.27 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.11 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.43 
 
 		 522 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.92 
 
 		 584 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.44 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  28.52 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  36.53 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.83 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.32 
 
 		 512 aa  97.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  35.93 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  35.93 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  35.93 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.5 
 
 		 313 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  35.33 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.16 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.9 
 
 		 335 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.49 
 
 		 352 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.41 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.11 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  35.2 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.5 
 
 		 353 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.22 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.78 
 
 		 424 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.41 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.59 
 
 		 526 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  35.36 
 
 		 734 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.65 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.68 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29 
 
 		 538 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  34.73 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.81 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.23 
 
 		 465 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.05 
 
 		 344 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  32.13 
 
 		 363 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.87 
 
 		 732 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.69 
 
 		 302 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.61 
 
 		 395 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.38 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.54 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.87 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.42 
 
 		 303 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>