More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2816 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  59.48 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  57.58 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  50.49 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  52.04 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  45.1 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  45.92 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  43.14 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.38 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  30.1 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  39.47 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.29 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  40.43 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  34.74 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  28.12 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  28.12 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  28.12 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  42.16 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33.94 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  42.16 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  43.02 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.85 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  27.08 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.91 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
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NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  33.7 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
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