More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2356 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  70.29 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  54.57 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 449 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  37.32 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 443 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  36.03 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  39.11 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  35.59 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  33.25 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  30.75 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  30.51 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.78 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 524 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 411 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.5 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  27.47 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  27.75 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  34 
 
 		 424 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.74 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  29.41 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  29 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.96 
 
 		 419 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  31.47 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  28.64 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  29.52 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.15 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.46 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  27.45 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.6 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>