More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2188 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  56.93 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  48.84 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0751  putative hydrolase  55.75 
 
 		 113 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.31973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  36.65 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.43 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.18 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.25 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.46 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  31.43 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  28.74 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.63 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.34 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.84 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.1 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  30.88 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  28.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  28.05 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.44 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  26.32 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  27.46 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.52 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>