135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0758 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  41.86 
 
 		 475 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  37.04 
 
 		 387 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 387 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  35.8 
 
 		 387 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 387 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.55 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  29.8 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  25.48 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  42.5 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.91 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  21.05 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.46 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.58 
 
 		 562 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.34 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  22.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  24.19 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  21.43 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.56 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  27.38 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  35.11 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  24.6 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.08 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  21.29 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  22.41 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  21.9 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 397 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  21.57 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4236  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  23.92 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  24.9 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  26.34 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  28.46 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  26.72 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.75 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  25.78 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  28.8 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  22.22 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  22.53 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  25.79 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.53 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>