58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0293 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  100 
 
 		 348 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.9 
 
 		 657 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  30.79 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  27.27 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  32.55 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.69 
 
 		 1016 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  27.97 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  24.72 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  27.82 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  29.1 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.62 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  25.78 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  25.51 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  27.27 
 
 		 1844 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  31.64 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.58 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  26.51 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.71 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  27.65 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  26.09 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  26.45 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  26.45 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  29.79 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  28.45 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  29.53 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  30.25 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  26.56 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  26.7 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 854 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.45 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.35 
 
 		 504 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.14 
 
 		 494 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  24.57 
 
 		 417 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  26.14 
 
 		 457 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  37.66 
 
 		 438 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  33.67 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  33.67 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  28.46 
 
 		 732 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  37.33 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  33.1 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  37.33 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  28.86 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.22 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  37.04 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.82 
 
 		 1027 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  30.33 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.73 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  36.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  24.53 
 
 		 729 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  27.65 
 
 		 732 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  26.62 
 
 		 729 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.46 
 
 		 1175 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>