110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0223 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  54.98 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  53.88 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.47 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  47.37 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.09 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  47.14 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.78 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.78 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.56 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  37.61 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  38.46 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  37.39 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.38 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.46 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.9 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  32.43 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.55 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  30.09 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.02 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  31.51 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  32.02 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.15 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.33 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.46 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.44 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  32.37 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  30.33 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  30 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.91 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.91 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  28.3 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.91 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.56 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  29 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.6 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.6 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  28.04 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.53 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  31.55 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  29.39 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.7 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  29.39 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.9 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.63 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.01 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  30.66 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.24 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.24 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.36 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  27.54 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  27.54 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.82 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.44 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.82 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  30.57 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.63 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.45 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.49 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  30.71 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.26 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.79 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.42 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.26 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.03 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.4 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.59 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.03 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.98 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.95 
 
 		 1785 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.56 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  25.35 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.5 
 
 		 637 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  35.88 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.81 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  27.88 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.47 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.7 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1857  putative GAF sensor protein  25.16 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  23.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  29.46 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 666 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  29.94 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.21 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  50.94 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 636 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  27.43 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.97 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.79 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.17 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.85 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0528  hypothetical protein  45.61 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.58 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>