More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0356 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  84.36 
 
 		 211 aa  362  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  82.55 
 
 		 212 aa  339  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  74.41 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  76.3 
 
 		 211 aa  304  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  70.48 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  66.98 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  71.63 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  68.08 
 
 		 213 aa  298  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  70.42 
 
 		 213 aa  298  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  69.05 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  68.87 
 
 		 212 aa  293  9e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  69.34 
 
 		 212 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 		 218 aa  291  6e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  71.09 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  65.09 
 
 		 212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  66.05 
 
 		 217 aa  284  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 		 215 aa  284  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  65.4 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  50.5 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  50.5 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 370 aa  201  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 303 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  48.13 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0746  uracil phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0774  uracil phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0787  uracil phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>