More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3675 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  544  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  36.33 
 
 
249 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  36.47 
 
 
250 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  35.8 
 
 
253 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
258 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
254 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.46 
 
 
254 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  34.92 
 
 
262 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  28.85 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 
254 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  31.1 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  31.37 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
241 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  30.71 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  30.47 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  31.35 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  31.5 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  30.31 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  31.5 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  31.5 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  31.5 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  29.84 
 
 
253 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
268 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
257 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.31 
 
 
252 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
250 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  35.91 
 
 
253 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 
252 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  31.54 
 
 
271 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 
250 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 
256 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
252 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  29.77 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  28.74 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  27.07 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 
252 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  27.76 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  40 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  34.1 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  29.37 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  51.35 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.29 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  39.2 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  38.75 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  39.8 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  41.12 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  30.42 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  41.67 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.52 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  42.19 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>