35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3521 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  88.63 
 
 		 422 aa  764    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  100 
 
 		 422 aa  857    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  62.56 
 
 		 422 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  55.29 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  39.02 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  36.08 
 
 		 461 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  35.7 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3509  putative phage integrase family protein  49.39 
 
 		 190 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  29.51 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1842  putative phage integrase family protein  47.66 
 
 		 113 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  25.52 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  29.21 
 
 		 490 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  24.28 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  27.93 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  26.51 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  22.81 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.64 
 
 		 556 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.64 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  21.51 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 568 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  26.18 
 
 		 635 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  32.45 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  24.33 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29.41 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  23.64 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  24.72 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  23.85 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.15 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.34 
 
 		 646 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>