More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2109 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2109  PfkB  100 
 
 
282 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  34.81 
 
 
313 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  28.42 
 
 
304 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0251  ribokinase-like domain-containing protein  37.23 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7369  ribokinase  36.21 
 
 
299 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  35.79 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.32 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  34.84 
 
 
308 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  28.52 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.68 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  33.8 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  34.49 
 
 
308 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.68 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 
300 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.03 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  37.02 
 
 
306 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.98 
 
 
308 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  33.33 
 
 
311 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
290 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  33.33 
 
 
311 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  35.21 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  34.51 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  34.63 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  30.61 
 
 
299 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  32.98 
 
 
311 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.37 
 
 
307 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  32.84 
 
 
321 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  33.09 
 
 
297 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  31.72 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.82 
 
 
302 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.42 
 
 
305 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  31.58 
 
 
321 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.58 
 
 
301 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.98 
 
 
309 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  34.7 
 
 
297 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  29.55 
 
 
308 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  32.42 
 
 
309 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  34.15 
 
 
324 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.86 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  31.16 
 
 
305 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  33.33 
 
 
305 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  33.8 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.53 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  32.99 
 
 
309 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  31.79 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  33.8 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  30.36 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  31.67 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.38 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.67 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  30.99 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  30.97 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  33.33 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  29.97 
 
 
317 aa  95.5  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  30.14 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  33.33 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  30.14 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  34.51 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.59 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.82 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  29.79 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30.5 
 
 
296 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  33.22 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.25 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  33.1 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.07 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.07 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  29.17 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  31.12 
 
 
305 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  33.82 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.18 
 
 
305 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  33.58 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.36 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  32.98 
 
 
295 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  32.97 
 
 
310 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.56 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  31.34 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  27.02 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  29.67 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  24.4 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.62 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  32.71 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.57 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  27.34 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  28.42 
 
 
308 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  22.92 
 
 
297 aa  87  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.32 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.75 
 
 
302 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  32.98 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  32.33 
 
 
327 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.81 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  34.34 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.21 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  30.1 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  28.82 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  30.77 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>