More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0427 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  100 
 
 
393 aa  810    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  63.27 
 
 
392 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  65.31 
 
 
392 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  65.05 
 
 
392 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  64.8 
 
 
392 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  62.85 
 
 
393 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  58.94 
 
 
397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  50 
 
 
398 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  46.55 
 
 
413 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  47.67 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  44.7 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  44.7 
 
 
402 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  46.37 
 
 
423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  44.68 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  44.19 
 
 
402 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  43.8 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  44.07 
 
 
397 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  44.3 
 
 
398 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  46.11 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  44.3 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  43.99 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  46.84 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  45.24 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  44.27 
 
 
398 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  43.15 
 
 
398 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  45.57 
 
 
396 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  44.13 
 
 
398 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  45.09 
 
 
398 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  45.88 
 
 
412 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  43.18 
 
 
401 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  44.04 
 
 
408 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  44.44 
 
 
416 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  41.19 
 
 
407 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  41.41 
 
 
407 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  42.39 
 
 
410 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  42.39 
 
 
410 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  42.39 
 
 
410 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  42.39 
 
 
410 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  42.89 
 
 
410 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  42.3 
 
 
401 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  41.08 
 
 
420 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  39.65 
 
 
409 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  41.33 
 
 
398 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  43.16 
 
 
399 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  41.16 
 
 
460 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  41.54 
 
 
395 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  41.91 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  39.74 
 
 
396 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  42.49 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  39.95 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  41.83 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  43.21 
 
 
387 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  43.34 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  41.92 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  43.08 
 
 
400 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  40.51 
 
 
399 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  42.93 
 
 
409 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  39.64 
 
 
417 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  37.38 
 
 
408 aa  279  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  39.8 
 
 
399 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  43.08 
 
 
401 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  43.08 
 
 
406 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  40.15 
 
 
399 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  43.24 
 
 
404 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  40.15 
 
 
405 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  42.04 
 
 
400 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  42.97 
 
 
404 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  40.15 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  41.43 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  41.78 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  39.49 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  42.2 
 
 
399 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  41.56 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  40.41 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  41.99 
 
 
397 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  35.78 
 
 
412 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  40.67 
 
 
405 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  41.1 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  41.1 
 
 
415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  41.1 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  41.1 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  41.1 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  40.85 
 
 
410 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  39.44 
 
 
434 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  35.66 
 
 
378 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
386 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.43 
 
 
383 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  32.51 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
396 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.77 
 
 
391 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.88 
 
 
392 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.61 
 
 
388 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.14 
 
 
388 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  27.89 
 
 
390 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.85 
 
 
389 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.4 
 
 
390 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>